Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb3Q9R1P1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb3Q9R1P1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb3Q9R1P1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms