Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mpdu1Q9R0Q9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mpdu1Q9R0Q9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mpdu1Q9R0Q9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms