Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SrpxQ9R0M3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SrpxQ9R0M3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms