Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr54Q9R0D8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr54Q9R0D8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr54Q9R0D8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms