Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpc6Q9R087 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gpc6Q9R087 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gpc6Q9R087 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gpc6Q9R087 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gpc6Q9R087 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Gpc6Q9R087 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Gpc6Q9R087 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Gpc6Q9R087 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gpc6Q9R087 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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