Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clcf1Q9QZM3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Clcf1Q9QZM3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms