Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Phtf1Q9QZ09 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Phtf1Q9QZ09 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Phtf1Q9QZ09 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms