Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL0

Hils1, Spermatid-specific linker histone H1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hils1Q9QYL0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Hils1Q9QYL0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hils1Q9QYL0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms