Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdzd4Q9QY39 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdzd4Q9QY39 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdzd4Q9QY39 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms