Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip4Q9QXN3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trip4Q9QXN3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trip4Q9QXN3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Trip4Q9QXN3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trip4Q9QXN3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trip4Q9QXN3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip4Q9QXN3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip4Q9QXN3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trip4Q9QXN3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms