Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg2Q9QXK3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Copg2Q9QXK3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Copg2Q9QXK3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Copg2Q9QXK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms