Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trp53inp1Q9QXE4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trp53inp1Q9QXE4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms