Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cyhr1Q9QXA1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cyhr1Q9QXA1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms