Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rai2Q9QVY8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rai2Q9QVY8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rai2Q9QVY8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms