Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arl6ip1Q9JKW0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms