Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Scamp4Q9JKV5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scamp4Q9JKV5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Scamp4Q9JKV5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms