Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole3Q9JKP7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole3Q9JKP7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole3Q9JKP7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pole3Q9JKP7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pole3Q9JKP7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pole3Q9JKP7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pole3Q9JKP7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pole3Q9JKP7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pole3Q9JKP7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms