Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nectin1Q9JKF6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Nectin1Q9JKF6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Nectin1Q9JKF6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms