Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trem3Q9JKE1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trem3Q9JKE1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms