Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl1Q9JI74 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl1Q9JI74 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms