Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Exosc9Q9JHI7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Exosc9Q9JHI7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Exosc9Q9JHI7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Exosc9Q9JHI7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Exosc9Q9JHI7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Exosc9Q9JHI7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Exosc9Q9JHI7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Exosc9Q9JHI7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Exosc9Q9JHI7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Exosc9Q9JHI7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms