Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Brd4Q9ESU6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Brd4Q9ESU6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Brd4Q9ESU6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Brd4Q9ESU6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms