Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK3

Capn10, Calpain-10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn10Q9ESK3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Capn10Q9ESK3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Capn10Q9ESK3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Capn10Q9ESK3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.3 ms