Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ush1cQ9ES64 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ush1cQ9ES64 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms