Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim54Q9ERP3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim54Q9ERP3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim54Q9ERP3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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