Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
V1ra8Q9EQ48 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
V1ra8Q9EQ48 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms