Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfrsf21Q9EPU5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfrsf21Q9EPU5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms