Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ndufa8Q9DCJ5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ndufa8Q9DCJ5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufa8Q9DCJ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufa8Q9DCJ5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufa8Q9DCJ5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufa8Q9DCJ5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ndufa8Q9DCJ5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms