Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Eif3fQ9DCH4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Eif3fQ9DCH4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Eif3fQ9DCH4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms