Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cpne8Q9DC53 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cpne8Q9DC53 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cpne8Q9DC53 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms