Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf6Q9DBU5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf6Q9DBU5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf6Q9DBU5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms