Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tysnd1Q9DBA6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tysnd1Q9DBA6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tysnd1Q9DBA6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms