Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cab39lQ9DB16 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cab39lQ9DB16 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms