Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAJ8

1700008P02Rik, MCG13911, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700008P02RikQ9DAJ8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1700008P02RikQ9DAJ8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
1700008P02RikQ9DAJ8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms