Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
1700018B08RikQ9DA83 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
1700018B08RikQ9DA83 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
1700018B08RikQ9DA83 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
1700018B08RikQ9DA83 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms