Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp12Q9D9M2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp12Q9D9M2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms