Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D8Q6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8Q6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8Q6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8Q6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8Q6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8Q6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8Q6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8Q6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8Q6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D8Q6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q9D8Q6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q9D8Q6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q9D8Q6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8Q6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8Q6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8Q6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8Q6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8Q6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8Q6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8Q6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8Q6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D8Q6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8Q6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8Q6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8Q6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D8Q6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms