Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Chmp4bQ9D8B3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Chmp4bQ9D8B3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Chmp4bQ9D8B3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms