Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cldn22Q9D7U6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cldn22Q9D7U6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cldn22Q9D7U6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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