Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capns2Q9D7J7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capns2Q9D7J7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capns2Q9D7J7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Capns2Q9D7J7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms