Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp4cQ9D7F7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp4cQ9D7F7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Chmp4cQ9D7F7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms