Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D7E4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D7E4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms