Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf225Q9D7D1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf225Q9D7D1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf225Q9D7D1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf225Q9D7D1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf225Q9D7D1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf225Q9D7D1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf225Q9D7D1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rnf225Q9D7D1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms