Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Srp19Q9D7A6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Srp19Q9D7A6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Srp19Q9D7A6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms