Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nop56Q9D6Z1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nop56Q9D6Z1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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