Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbe1Q9D6Y9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms