Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Borcs8Q9D6Y4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Borcs8Q9D6Y4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms