Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Borcs6Q9D6W8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Borcs6Q9D6W8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Borcs6Q9D6W8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Borcs6Q9D6W8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Borcs6Q9D6W8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Borcs6Q9D6W8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Borcs6Q9D6W8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Borcs6Q9D6W8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Borcs6Q9D6W8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms