Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tube1Q9D6T1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tube1Q9D6T1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tube1Q9D6T1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms