Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Calml3Q9D6P8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Calml3Q9D6P8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Calml3Q9D6P8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms